哈尔滨医科大学的李霞教授研究组最近在NAR上发表了一个CellMarker数据库。
细胞标志物(Marker)是对细胞定义和分选的重要标志。特别是随着单细胞测序技术的普及,对组织内的细胞进行检测并进行T-SNE聚类后,通常会面临一个问题:特异性表达某些基因的这类细胞有什么特性?不同细胞类型,如:上皮/内皮/B细胞/T细胞/干细胞/成纤维细胞等Marker是什么?
CellMarker数据库详细的搜集了10万多片已经发表的文章,汇集了不同物种和不同组织,以及不同细胞类型的marker,给科研工作者的科研带来极大的便利。数据库包括人和小鼠的细胞标记物。数据库的功能包括:浏览(Browser), 搜索(Search), 提交(Submit) 和下载 (Download)。
数据库的功能很简单,只需要试着点击几下就知道怎么玩了。
Reference
CellMarker: a manually curated resource of cell markers in human and mouse