Cell Marker Database

哈尔滨医科大学的李霞教授研究组最近在NAR上发表了一个CellMarker数据库

细胞标志物(Marker)是对细胞定义和分选的重要标志。特别是随着单细胞测序技术的普及,对组织内的细胞进行检测并进行T-SNE聚类后,通常会面临一个问题:特异性表达某些基因的这类细胞有什么特性?不同细胞类型,如:上皮/内皮/B细胞/T细胞/干细胞/成纤维细胞等Marker是什么?

CellMarker数据库详细的搜集了10万多片已经发表的文章,汇集了不同物种和不同组织,以及不同细胞类型的marker,给科研工作者的科研带来极大的便利。数据库包括人和小鼠的细胞标记物。数据库的功能包括:浏览(Browser), 搜索(Search), 提交(Submit) 和下载 (Download)。

数据库的功能很简单,只需要试着点击几下就知道怎么玩了。

Reference

CellMarker: a manually curated resource of cell markers in human and mouse

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因为不想遗忘! 在这个信息大爆炸的年代,最重要的是对知识的消化-吸收-重铸。每天学了很多东西,但是理解的多少,以及能够运用多少是日后成功的关键。作为一个PhD,大脑中充斥了太多的东西,同时随着年龄的增长,难免会忘掉很多事情。所以只是为了在众多教程中写一个自己用到的,与自己...… Continue reading