Online tools for Bioinformatics
韦恩图
工具：Venny2.0
地址：http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html
升级版韦恩图
jvenn: 可做到6个
基因预测
工具：FGENESH
地址：http://linux1.softberry.com/berry.phtml?topic=fgenesh&group=programs&subgroup=gfind
phylogenetic
工具：iTOL
地址：http://itol.embl.de/index.shtml
工具：在线构建进化树 IQTREE Web Server: Fast and accurate phylogenetic trees under maximum likelihood
启动子区预测
工具：Promoter Scan
地址：http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/
蛋白质一级结构分析
工具：PredictProte
地址：https://www.predictprotein.org/home
工具：ExPASy-ProtParam tool
地址：http://web.expasy.org/protparam/
蛋白质磷酸化位点
信号肽
工具：SignalP
地址：http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
跨膜结构域
工具：TMHMM Server v. 2.0
地址：http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/
蛋白质亚细胞定位
工具：PSORT II Prediction
地址：http://psort.hgc.jp/form2.html
蛋白质三级结构预测
工具：SWISS-MODEL
地址：http://swissmodel.expasy.org/interactive
短序列拼接
工具：Cap3
地址：http://doua.prabi.fr/software/cap3
多序列比对相似性展示
工具：SimiTriX-SimiTetra
地址：http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php
多序列比对可视化
MView: A multiple alignment viewer
AlignmentViewer
绘制GO注释结果
工具：WEGO（Web Gene Ontology Annotation Plotting）
地址：http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl
元数据可视化
Web-Igloo：Interactively visualizing multivariate data without feature decomposition
蛋白质domain
工具：Pfam database
地址：http://pfam.xfam.org/
基因组杂合性评估
工具：GenomeScope（Estimate genome heterozygosity, repeat content, and size from sequencing reads using a kmer-based statistical approach）
地址：http://qb.cshl.edu/genomescope/analysis.php?code=example2
circos图
工具：CIRCOS（可以用来画基因组数据的环状图，也可以用来绘制其它数据的相关环状图。）
地址：http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/
- 需要注意的是上传数据格式为空格或tab分隔的txt格式纯文本列表文件，值均为非负整数，若存在缺失值，用“-”线代替，若有小数，每一个单元格乘以某一值（如1000），化为整数，且每个单元格中只能有数字，其他任何符号都不行，除了缺失的“-”，（1555，而不是1555）。
- 在线版只能绘制75阶方阵数据，若需要绘制较复杂的请下载Circos and use the tableviewer tool。
- 每一个标签所对应半圈的总长度为这一标签所对应的所有值的和，不同半圈间连线表示这两标签所表示的值。
